Le Ministère a sollicité différents partenaires techniques afin de l'accompagner dans la précision des enjeux de cohérence nationale Trame verte et bleue. Pour rappel, ces enjeux sont destinés à assurer une cohérence écologique entre les différents SRCE réalisés librement par les régions. Les rapports de proposition remis au Ministère par le Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN-SPN), la Fédération des conservatoires botaniques nationaux (FCBN) et l'Office pour les insectes et leur environnement (OPIE) sont présentés ci-dessous. Ces propositions ont alimenté les travaux relatifs à la définition des futures "orientations nationales pour la préservation et la remise en bon état des continuités écologiques", prévues par la loi portant engagement national pour l’environnement du 12 juillet 2010. Ces orientations ne seront définitives qu’après leur adoption par décret en Conseil d’État (décret n° 2014-45 du 20 janvier 2014).